Ada dua cara yaitu: lewat File Manager atau pakai FTP Client. Di sini hanya dijelaskan menggunakan File Manager, untuk FTP client lihat judul lain.

1. Melalui File Manager yang ada di Cpanel.
Setelah login cpanel, klik ikon File Manager

2. Tampilan File Manager adalah spt di bawah ini.
Semua file website harus diupload di bawah folder "www" atau "public_html" (kedua folder ini sama sebenarnya).

Untuk masuk ke folder www, klik gambar folder warna kuning di kiri (ingat, klik gambar folder di sebelah kiri www, bukan klik link www lho ya).

3. Setelah itu, untuk mengupload file, klik link Upload File(s)

4. Di bawah ini adalah tampilan siap upload. Silahkan klik Browse untuk mencari lokasi file yang akan diupload. Setelah semua file sudah dipilih, setelah itu klik tombol Upload

5. Untuk mengupload folder yang ada file-filenya, maka harus dibuat dulu nama folder di File Manager secara manual, klik Create New Folder. Setelah Folder terbentuk, baru Anda masuk ke folder tersebut dengan cara mengklik gambar folder kuning di kiri nama folder. Setelah masuk ke dalam folder itu baru file-file diupload.

6. Untuk mendelete/menghapus atau mengedit file atau folder, caranya dengan mengklik link nama file atau folder tersebut. Ingat, yang diklik kali ini bukan gambar folder kuning tapi link nama file atau nama folder. Kemudian lihat di sisi kanan atas maka akan tersedia menu delete file, edit, change permisions, rename file, copy file, dan move file.

7. Terkadang ada permintaan untuk mengubah permission file atau folder dengan tujuan tertentu, salah satunya agar bisa rewrite file. Misalnya, ada permintaan untuk mengubah permission file/atau folder ke 777, maka caranya sama dengan langkah nomor 7, hanya kali ini yang diklik adalah link Change Permission di sisi kanan. Kemudian ubah permission dengan mencentang sehingga akan muncul angka 777.